La Fondazione Housing Sociale è stata costituita dalla Fondazione Cariplo con la partecipazione, fin dalle prime fasi del progetto, della Regione Lombardia e dell'ANCI Lombardia.
All'interno del Consiglio di Amministrazione della Fondazione siedono in particolare un Consigliere nominato dalla Regione Lombardia e uno dall'ANCI Lombardia, con l'obiettivo di agevolare il coordinamento tra l'attività e gli obiettivi con quelli dell'autorità regionale e degli enti locali della Lombardia.
